بعد از صدور حکم صادره مبنی بر محکومیت متهم به اجرای مجازات شلاق، در شرایطی که متهم در زندان بوده یا آزاد باشد مجازات شلاق به دو شکل متفاوت اجرا می گردد:

1. اجرای مجازات شلاق راجع به محکوم محبوس

اگر شخص محکوم به مجازات شلاق در زندان باشد و مکان معینی برای اجرای شلاق تعیین نشده باشد طی نامه ای به اداره زندان اعلام می شود تا مجازات شلاق اجرا گردد.

از آنجایی که اجرای مجازات شلاق با مرجع انتظامی است کلیه نامه های اجرای مجازات شلاق که تا پایان وقت اداری به زندان واصل می شود جمع آوری و در پایان وقت اداری، مامور اجرای شلاق نیروی انتظامی در زندان حاضر شده و در صورتی که مانعی برای اجرای حکم وجود نداشته باشد مجازات شلاق را اجرا می کند.

2.اجرای مجازات شلاق راجع به مجرم آزاد

در رابطه با مجرمی که محکوم به شلاق حدی و تعزیری شده در صورتی که محبوس نباشد قاضی اجرای احکام طی احضاریه ای به مرتکب او را برای حضور جهت اجرای حکم جلب می کند بعد از حضور و احراز هویت مرتکب جرم صورت جلسه ای تنظیم و شخص جهت اجرای حکم به مرجع انتظامی معرفی می شود.

3.تردید در شمارش شلاق 

اجرای حکم شلاق با نظارت قاضی اجرای احکام انجام و توسط نماینده وی شمارش می شود اما چنانچه شک و تردیدی برای تعداد مجازات شلاق به وجود آید. اصل بر حداکثر گذاشته می شود.